Mokyklų veiklos tobulinimo skyriaus funkcijos:

• Analizuoja mokyklų veiklai tobulinti reikalingus duomenis ir formuluoja mokyklų veiklai tobulinti reikalingų duomenų poreikį, teikia informaciją apie tai pagal kompetenciją atsakingiems kitiems centro skyriams ar kitoms institucijoms.
• Kuria ir išbando mokyklų veiklos tobulinimo modelius.
• Analizuoja mokyklų veiklos tobulinimo rezultatus, vykdo gerosios mokyklų veiklos tobulinimo patirties sklaidą nacionaliniu mastu.
• Remdamasis mokyklos vidaus ir išorės vertinimo rezultatais, organizuoja mokyklos veiklai tobulinti reikalingų priemonių rengimą ir įgyvendinimą.
• Konsultuoja mokyklas joms aktualiais veiklos klausimais.
• Teikia siūlymus LR švietimo ir mokslo ministerijai dėl veiksmingo ir kokybiško mokyklų veiklos tobulinimo.
• Pagal kompetenciją bendradarbiauja su valstybės ir savivaldybių institucijomis bei įstaigomis, teikia informaciją ir metodinę pagalbą, konsultuoja jas skyriaus kompetencijai priskirtais klausimais.
• Telkia ir palaiko švietimo konsultantų tinklus, reikalingus mokyklų veiklos tobulinimo klausimams spręsti.
• Organizuoja priemones, susijusias su daugiafunkcių centrų ir mokyklų bibliotekų veiklos plėtra.
• Pagal kompetenciją dalyvauja centro, valstybės ir savivaldybių institucijų bei įstaigų sudarytų darbo grupių ir komisijų veikloje.
• Pagal kompetenciją analizuoja centro vykdomas veiklas ir teikia apibendrintą informaciją kitiems centro skyriams.
• Vykdo kitas teisės aktų nustatytas funkcijas ir centro direktoriaus pavedimus.
• Atsiskaito už veiklą centre nustatyta tvarka.